胆囊是胆管的延伸，胆囊炎与胆管炎发病模式比较接近，两者经常相互影响，同时发生。猫常发生嗜中性粒细胞性胆管炎，淋巴细胞性胆管炎，硬化性胆管炎。犬常发嗜中性粒细胞性胆管炎、胆囊粘液囊肿。
犬猫嗜中性粒细胞性胆管炎和胆囊炎被认为和小肠细菌上行感染有关，最常见的病原微生物是大肠杅菌，链球菌、产气荚膜梭菌、沙门氏菌等均可引发该病。主要表现在嗜中性粒细胞浸润胆管腔和胆管壁，胆囊腔和胆囊壁，门脉区也常见水肿和嗜中性粒细胞浸润，也会偶发肝脏脓肿。常并发胰腺炎和肠道疾病。
淋巴细胞性胆管炎和胆囊炎是一种慢性进行性疾病。其病因不详，临床表现和组织学检查变化多端，提示病因可能不止一种，有些研究怀疑该病是免疫介导性的，但免疫抑制治疗无效。
胆囊粘液囊肿病因暂不明确，但多发于中老年犬，并有一定的品种倾向（如可卡和迷你雪纳瑞可能易发感染、胆囊动力紊乱，喜乐蒂易发血脂异常），还有甲状腺机能减退犬也易发。