题目：ATNFR2-hnRNPKaxispromotesprimarylivercancerdevelopmentvia
activationofYAPsignalinginhepaticprogenitorcells
中文题目：TNFR2-hnRNPK轴激活肝祖细胞的YAP信号促进原发性肝癌的发生
期刊：CancerResearch（IF=9.）
PMID:
单细胞技术平台：10xGenomics
基于UMI条码定量策略的高通量单细胞测序技术不仅可以帮助我们检测一团组织中的细胞类群组成，还可以反馈出单一细胞内的基因表达水平。极大的丰富了我们对组织中细胞功能及生化反应的了解。复旦大学的周兆才老师应用单细胞测序挖掘出肝祖细胞的原发性癌变机制：TNFR2-hnRNPK轴激活肝祖细胞的YAP信号促进原发性肝癌的发生，该机制在体内外实验中均得到了验证。
单细胞测序发现了一个HPC群体：同时存在TNFR2、hnRNPK和YAP
本研究对2例原发性肝癌（primarylivercancer，PLC）患者的临床样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析（个细胞）。T-SNE聚类分析：CD4+T细胞，CD8+T细胞，调节性T(Treg)细胞，B细胞，DC细胞，肿瘤相关成纤维细胞(TAFs)细胞，肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)，肝窦内皮细胞(LSECs)，肿瘤相关肝祖细胞HPLC-like（图1）。
通过基于转录组推断大规模的染色体拷贝数变异(CNVs)，本研究进一步鉴别了个恶性细胞(图1，图2)。
作者推断的CNV谱与之前发表的HCCCNV谱一致(PMID：)。接下来，本研究基于拟时序算法确定HPC-like细胞和恶性细胞的运动轨迹。本研究发现HPC-like分支倾向于聚集在轨迹树的主干，而恶性细胞聚集在分支（图3），提示恶性细胞可能来源于（图3）群体。
EPCAM+细胞被认为是HPC-like细胞，因为它们在培养时可以形成密集的圆形集落，是肝细胞的双潜能祖细胞，最终在体内和体外分化为胆管细胞或肝细胞(PMID：,PMID：)。
该究鉴定了与EPCAM,TNFRSF1B,TNFRSF1A,HNRNPK,和YAP1在这些细胞内的表达,发现TNFRSF1B的表达是远远高于TNFRSF1A。此外,我们发现TNFR2的同现,HNRNPK和YAPpatient-derivedHPC-like。与TNFR2对YAP活性的正调控一致，GSEA发现TNFRSF1B-HPC-like中一组YAP靶基因的表达减少(图4)。
该究继续在患者肝癌组织的单细胞水平上展示CTGF、CYR61、ELK1、ELK4、STAT3的表达谱。ELK4和STAT3的情况与YAP1极为相似（图5）。
总之，这些结果表明TNFR2、hnRNPK、YAP以及这些致癌靶基因在HPC-like细胞中共存，进一步支持了TNFR2-hnRNPK-YAP信号通路对HPC介导的PLC发展至关重要的观点。
转自：伯豪生物
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